目前，普遍认为苹果苦痘病与果实缺钙有关，科学家确实观察到得了苦痘病的苹果中钙和硼含量低，而氮、钾、磷和镁含量都高于正常果实；套袋在一定程度降低了果实的蒸腾速率和钙的含量，但也发现喷钙不能完全阻止苦痘病的发生。对比调查发现：品种特性、树体养分、树势、树体负载量、采收时期以及贮藏环境等因素都会影响发病率。而且，往往是在我们用肥多，苹果长势喜人，脱毒苹果苗是怎么回事，果实个大，以为一定是个大丰收的时候，双脱毒苹果苗，苦痘病却严重发生了。
早期形成的苦痘病，皮下呈海绵状而不腐烂。采收前形成的红点、黑点，应区别是侵染害还是生理病害。侵染害形成的红点、黑点，迅速扩大并深入果肉而腐烂。缺钙形成的红点、黑点，凹陷干缩成为黑疤而不腐烂，也称为苦痘病。用刀轻轻削去表皮，如果皮下呈海绵状，即是果实膨大期形成的缺钙症状。如果皮下果肉正常，脱毒苹果苗，即是果实成熟期形成的缺钙症状。缺钙的苹果，贮藏期也容易出现苦痘病、水心病、黑皮变软等症状
蓬莱姜忠伟，全套使用现代果业产品6年，他跟我说，他每亩地每年平均投入七千左右的肥钱，他说只跟我们说说，以前参加现代果业冬季培训班的时候也有人问他，他只说三四千块钱，我问他为什么说谎。
他说：“别人总笑话，说投入两千块钱，产的果也挺好”，我又问：“那您每亩纯收入多少？”他答：“两万七八千吧！我还有个朋友，我们经常一起出去剪树，他每亩纯收入3万多，不过他投的也多，一亩地不下一万块钱的肥，有机肥一棵树就是一袋子，有的树一袋子也不够啊！他就管两三亩地，地少，脱毒苹果苗培养过程，不累，但钱一点不少赚。有的人弄十亩八亩地，就是舍不花钱，树就不行，今年干了明年不干，果不是这病就是那病，一年净白忙活，不舍不得，你舍了才能得！”
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