二次发酵是目前实施的堆肥方法。具体方法是：室外发酵15~16天的培养材料，加热进入蘑菇房，堆放在培养架上，密封门窗，屋顶上覆盖塑料薄膜，直接用炭火炉或普通炉（炉子在室内，炉子在室外）预热，先加热10到12小时，使物料温度达到60-62°C，新闻报道羊肚菌的联系方式，保持24小时，然后通风到48~52°C，河南后赵楼羊肚菌的联系方式，发酵结束后维持4-6天。打开门窗，在材料平整后，栽培羊肚菌的联系方式，当材料温度降至28°C以下时，可以播种材料。二次发酵优于一次发酵的优势在于外部发酵后，然后在控制温度下。
在湿度和通风条件下室内发酵可以更好地改变培养物质的理化性质和微生物相，更彻底地杀灭细菌和害虫。培养材料的水分，温度和空气分布均匀分布，形成有利于蘑菇生长的生态环境。同时，它还可以更有效地增加蘑菇的营养。因此，两次发酵后，蘑菇菌丝生长迅速，产量高。关于二次发酵的主要注意事项是后发酵培养材料不应过度烹饪或过度生产。过熟，后期发酵不起，寿命过长，睡前高温不下降，容易出现美白现象，并造成水分不足，影响蘑菇生长。当将预发酵的培养材料放入床中时，水含量略高，并且在发酵结束后保持63％的含水量更好。二次发酵后的培养材料也是褐色，无气味，质地松散，有弹性，大量灰白粉（排出线jun及其孢子）均匀分布在材料中。
羊肚菌的生物学环境
1.温度、湿度。羊肚菌属低温高湿型菌，3～5月雨后多发生，8～9月也偶有发生。生长期长，除需较低气温外，还要较大温差，以刺激菌丝体分化。菌丝生长温度为21～24℃；子实体形成与发育温度为4.4～16℃，空气相对湿度为65%～85%。为此，栽培时间应在11～12月。
2.日照。微弱的散射光有利于子实体的生长发育。忌强烈的直射光。
3.土壤。土壤pH值宜为6.5～7.5，中性或微碱性有利于羊肚菌生长。羊肚菌常生长在石灰岩或白垩土壤中。在腐殖土、黑或黄色壤土、沙质混合土中均能生长。
4.空气。在暗处及过厚的落叶层中，羊肚菌很少发生。足够的氧气对羊肚菌的生长发育是必不可少的。
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